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为逃避抓捕，伍南方将当年在部队学到的反侦查手段又重新拾起来，并且发挥到极致。两年间，他先后北上北京、天津，南到深圳、广州，西至重庆、乌鲁木齐……几乎跑遍大江南北。他深知手机的弊端，几乎从来不用手机，即使偶尔使用也是打完电话就换卡或者直接扔掉，然后立即动身去其他地方。
两年逃亡一身病
接到伍南方所在单位报案后，灵宝市检察院立即将伍南方列为在逃人员网上追逃，并根据需要及时成立了追逃工作小组，通过密切联系公安机关、大范围摸排调查、网上喊话等手段，向潜逃在外的伍南方施加压力。
终于，在强大的政治攻势下，潜逃两年之久的伍南方于2014年12月20日从重庆给灵宝市检察院打电话，要求投案自首。到案后，伍南方如实供述了自己被一些网站诱骗，挪用公款用于购买彩票中奖号码的事实。
“在外潜逃的那两年，我几乎没睡过安稳觉，一合上眼睛就梦见被抓住，最可怜的是有一回，一整天只吃了一个馒头。更难受的是心理煎熬，自杀的念头像沉重的巨石，一次次在脑海里碾过……那简直不是人过日子!”伍南方回忆说。
2015年2月25日，河南省灵宝市检察院对伍南方挪用公款案依法提起公诉。2015年3月13日上午9时，该案在灵宝市法院一号审判庭开庭审理。庄严的审判大厅内，伍南方坐在被告人席上，一头花白的头发让这个刚刚五十出头的人显得比实际年龄苍老许多;那曾在战场上锐利无比的侦察员的目光，如今暗淡在老花镜后面，再无往日神采……
2015年4月7日，灵宝市法院一审判决如下：被告人伍南方犯挪用公款罪，判处有期徒刑十一年零六个月;伍南方违法所得234.6万元，追还灵宝市人民政府金融服务办公室。
接过判决书，伍南方当庭表示上诉。但无论他对判决结果如何不满，命运似乎已经注定。其实对这样的结果，伍南方早有预见。曾经的功臣，已经堕落为阶下囚。
2015年5月22日，三门峡市中级法院下发刑事裁定书：准许伍南方撤回上诉，原审判决发生法律效力。由于长期潜逃，积劳成疾，伍南方已经病得生活不能自理，最终法院依据相关规定，决定对其暂予监外执行。
监外执行期间，伍南方的病情逐渐好转，恢复生活自理能力。2015年9月，灵宝市检察院刑事执行检察局在对伍南方进行常规跟踪检查时，发现其身体情况已经可以收监，于9月15日向灵宝市法院发出检察建议书。
当日，伍南方被收押在三门峡监狱，开始了他的监狱生活。
