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南朝时注重对水军的训练和检阅，玄武湖成为南朝各代训练水军的场所。
南朝宋大明五年和七年，宋孝武帝两次阅武于玄武湖西岸。齐永明二年，齐武帝阅兵于玄武湖。陈太建十一年，陈宣帝阅兵于玄武湖。陈至德四年，陈后主至玄武湖阅兵。
有一首《昆明治水战词》这样记叙南朝宋孝武帝时阅兵：“汪汪积水光连空，重叠细纹交敛红。赤帝龙孙鲜甲怒，临流一眄生阴风。鼍鼓三声报天子，雕旗兽舰凌波起。雷吼涛惊白若山，石鲸眼裂蟠蛟死。”形象地描述了宋孝武帝亲自披甲指挥，湖上战鼓雷动、战舰凌波、士兵杀声震天的壮观场面。北朝则出现了军阵双方对抗性演习。
